Les Moluques doivent leur réputation de l’époque où les noix de muscades, les clous de girofle et le macis (enveloppe de la noix de muscades) étaient produit que dans ces îles et nulle part ailleurs dans le monde. Il n’est pas étonnant en conséquence, que l’archipel ait attiré la convoitise des marchands puis des colonisateurs. On s’est donc beaucoup battu pour s’approprier le juteux commerce des épices connu déjà des Arabes et des Chinois. Apres, les Espagnols, les Portugais, et les Anglais, ce sont les Hollandais qui parvinrent à garder sur la plus longue période, leur domination sur ce commerce.
Depuis que des plans et graines furent volés par des Anglais et des Français (Mr Poivre), pour aller les cultiver sur les côtes africaines de Zanzibar et les îles de la Réunion et Maurice, les Moluques retombèrent dans l’oubli.
Restées peu peuplées, les Moluques sont devenue depuis l’indépendance de l’Indonésie une destination convoitée par les Javanais et habitants de Sumatra. Une nouvelle colonisation est donc en train de s’opérer, non sans provoquer des affrontements entre population locale et immigrant. Des émeutes meurtrières endeuillèrent les îles principales de l’archipel dans les années 2000, souvent présentées comme des conflits religieux de Musulmans contre des Chrétiens. Il s’agit plutôt de rébellions des populations autochtones moins développées, contre l’envahisseur indonésien occidental, venu faire fortune dans des terres encore peu habitées.
La province indonésienne des Moluques s’étant sur 1000km du nord au sud et plus de 800 km d’ouest en Est. Un groupe d’îles au nord compte celle d’Halmahera, la plus grande et très découpée, avec le long de ses côtes les anciens sultanats de Ternate et Tidore. Dans la zone méridionale, autour de la mer de Banda, où sont perdues les îles du même nom, s’égrènent les îles de Seram, Ambon, et au sud en prolongement des petites îles de la sonde, plusieurs archipels dont celui d’Aru, le plus à l’est. Toute la région est fortement volcanique. Situé dans des mers chaudes, traversées par des courants entre Pacifique et océan Indien, les fonds marins regorgent de poissons de toutes tailles et les côtes offrent des paysages coralliens parmi les plus beaux du monde.